1. Svarbiausieji skyriaus uždaviniai:
1.1. tikrinti ir vertinti, ar audituojamajame Ūkio ministerijos ir jai pavaldžiuose viešuosiuose juridiniuose asmenyse sukurta ir įdiegta vidaus kontrolės sistema yra pakankama ir veiksminga, ar jų veikla atitinka įstatymus ir kitus norminius teisės aktus, jų vietinių (lokalinių) norminių teisės aktų reikalavimus, ar informacija apie finansinę ir ūkinę veiklą yra išsami ir patikima, ar pasiekti nustatyti tikslai ir uždaviniai;
1.2. teikti ūkio ministrui, Ūkio viceministrams, Ūkio ministerijos kancleriui, Ūkio ministerijos pavaldžių viešųjų juridinių asmenų vadovams objektyvią informaciją, rekomendacijas ir išvadas dėl audituoto viešojo juridinio asmens veiklos, vidaus kontrolės būklės, strateginių arba kitų veiklos planų, programų vykdymo, galimos arba nustatytos veiklos rizikos audituotuose Ūkio ministerijos ir jai pavaldžiuose viešuosiuose juridiniuose asmenyse.

2. Skyrius, vykdydamas jam pavestus uždavinius, atlieka šias funkcijas:
2.1. tikrina ir vertina Ūkio ministerijos ir jai pavaldžiuose viešuosiuose juridiniuose asmenyse:
2.1.1. vidaus kontrolės sistemos funkcionavimą (nustatytų vidaus taisyklių, vidaus kontrolės procedūrų veiksmingumą, pakankamumą ir jų laikymąsi, organizacinės struktūros optimalumą, funkcijų paskirstymo, intelekto išteklių panaudojimo racionalumą ir kt.), rizikos veiksnių valdymo efektyvumą;
2.1.2. veiklos atitiktį Lietuvos Respublikos įstatymams, Lietuvos Respublikos Vyriausybės nutarimams, kitiems norminiams teisės aktams;
2.1.3. strateginių ir kitų veiklos planų įgyvendinimą, veiklos atitiktį jų tikslams ir uždaviniams, Lietuvos Respublikos valstybės biudžeto asignavimų valdytojų programų vykdymą, joms skirtų lėšų bei valstybės ir savivaldybės turto naudojimą efektyvumo, ekonomiškumo ir rezultatyvumo požiūriais;
2.1.4. finansinių ir veiklos ataskaitų duomenų teisingumą, apskaitos informacijos tinkamumą, objektyvumą, pateikimą laiku;
2.1.5. lėšų, gautų iš Europos Sąjungos, užsienio institucijų arba fondų, administravimą ir naudojimą;
2.1.6. turto apskaitą ir apsaugą;
2.1.7. informacinių sistemų saugumą, veiksmingumą ir informacinių sistemų projektus;
2.1.8. viešųjų pirkimų procedūrų vykdymą;
2.2. organizuoja išorės auditorių paslaugų pirkimą;
2.3. teikia konsultacijas ir rekomendacijas ūkio ministrui ir Ūkio ministerijai
(pavaldiems viešųjų juridinių asmenų vadovams vidaus kontrolės ir korupcijos prevencijos klausimais;
2.4. kasmet iki kovo 1 d. rengia ir teikia metines vidaus audito rezultatų apžvalgas ūkio ministrui, išskiriant ir analizuojant būdingiausias klaidas ir veiklos trūkumus;
2.5. ne rečiau kaip kartą per 3 (trejus) metus rengia vidaus kontrolės sistemos Ūkio ministerijoje ir jai pavaldžiuose viešuosiuose juridiniuose asmenyse, veikimo ataskaitą;
2.6. VIAS nustačius pažeidimus, nagrinėtinus atitinkamų teisėsaugos institucijų, perduoda atitinkamą medžiagą teisėsaugos institucijoms pagal kompetenciją;
2.7. atlieka Europos Sąjungos paramos lėšų panaudojimo privalomuosius patikrinimus pagal Europos Komisijos reikalavimus;
2.8. vertina audituojamojo viešojo juridinio asmens lėšų, gautų iš Europos Sąjungos ir užsienio institucijų ar fondų, administravimą ir naudojimą;
2.9. rengia vidaus audito ataskaitas su išvadomis ir rekomendacijomis, kaip ištaisyti vidaus audito metu nustatytus neatitikimus, kaip tobulinti Ūkio ministerijos ir jai pavaldžių viešųjų juridinių asmenų veiklą ir vidaus kontrolę;
2.10. atlieka pažangos stebėjimą (veiklą po audito);
2.11. teisės aktų nustatytais terminais rengia VIAS veiklos ataskaitą ir teikia ją ūkio ministrui;
2.12. nustatyta tvarka teikia dokumentus Lietuvos Respublikos valstybės kontrolei ir Lietuvos Respublikos finansų ministerijai;
2.13. organizuoja VIAS dokumentų tvarkymą ir apskaitą, užtikrina tinkamą dokumentų saugojimą ir perdavimą nustatytąja tvarka į Ūkio ministerijos archyvą;
2.14. teikia ūkio ministrui rekomendacijas dėl korupcijos prevencijos sistemos Ūkio ministerijoje ir jai pavaldžiuose viešuosiuose juridiniuose asmenyse;
2.15. atlieka korupcijos rizikos valdymo vertinimą;
2.16. renka, sistemina, apibendrina informaciją apie korupcijos apraiškas ir atlieka patikrinimus ir tyrimus visose veiklos srityse;
2.17. tobulina Vidaus ir išorės audito skyriaus valdymo procesą ir darbo organizavimo metodus:
2.17.1. rengia, teikia ūkio ministrui tvirtinti Vidaus ir išorės audito skyriaus vidaus dokumentus (nuostatus; pareigybių aprašymus; vidaus audito metodiką; lėšų, gautų iš Europos Sąjungos, užsienio institucijų arba fondų, administravimo ir panaudojimo vidaus audito metodiką ir kt.);
2.17.2. teikia pasiūlymus ūkio ministrui dėl sutarčių sudarymo su išorės auditoriais ar ekspertais dėl kai kurių vidaus audito funkcijų atlikimo;
2.17.3. siekiant efektyviai atlikti vidaus auditus, keičiasi informacija su kitų valstybinės valdžios ir valdymo institucijų ir įstaigų auditoriais bei ekspertais;
2.18. vykdo kitus ūkio minsitro pavedimus, susijusius su Vidaus ir išorės audito skyriaus priskirta komepetencija.
2.19. Vidaus ir išorės audito skyrius įgyvendina savo uždavinius ir funkcijas palaikydamas glaudžius ryšius su Ūkio ministerijos administracijos padaliniais ir jai pavaldžiais viešaisiais juridiniais asmenimis, keisdamasi su jais reikiama informacija ir dokumentais, kurių reikia funkcijoms vykdyti.